Penguen Arkadaşım, hayatını denizde geçiren yalnız bir balıkçı ile kaybolmuş bir penguenin kurduğu sıra dışı dostluğu anlatıyor. Bir petrol sızıntısından kurtarılan bu küçük penguen, balıkçının yalnız dünyasına anlam katarken, ikili arasında güçlü ve derin bir bağ oluşur. Okyanusun derinliklerine bile meydan okuyan bu dostluk, ikisini de geri dönüşsüz bir şekilde değiştirir.